일본 규슈 지방에 있는 현이며 현청소재지는 구마모토 시(市)이다. 북쪽·동쪽·남쪽이 산지로 둘러싸이고, 중앙부에 구마모토 평야가 펼쳐진다. 전국 유수의 농업 지역이며 양식업이 왕성하다. 세계 최대 규모의 칼데라를 가지는 아소 산(阿蘇山)이 유명하다.